建站
咨詢
售后
建站咨詢
新聞中心
這篇文章運(yùn)用簡(jiǎn)單易懂的例子給大家介紹python加載dicom圖片怎么實(shí)現(xiàn)，代碼非常詳細(xì)，感興趣的小伙伴們可以參考借鑒，希望對(duì)大家能有所幫助。
成都創(chuàng)新互聯(lián)長(zhǎng)期為上千多家客戶提供的網(wǎng)站建設(shè)服務(wù)，團(tuán)隊(duì)從業(yè)經(jīng)驗(yàn)10年，關(guān)注不同地域、不同群體，并針對(duì)不同對(duì)象提供差異化的產(chǎn)品和服務(wù)；打造開(kāi)放共贏平臺(tái)，與合作伙伴共同營(yíng)造健康的互聯(lián)網(wǎng)生態(tài)環(huán)境。為楊浦企業(yè)提供專業(yè)的成都網(wǎng)站建設(shè)、成都做網(wǎng)站，楊浦網(wǎng)站改版等技術(shù)服務(wù)。擁有十余年豐富建站經(jīng)驗(yàn)和眾多成功案例,為您定制開(kāi)發(fā)。
用python加載dicom圖片的方法：使用pydicom、CV2、numpy、matplotlib等庫(kù)即可。pydicom庫(kù)是專門用來(lái)處理dicom圖像的python專用庫(kù)。
python讀取DICOM圖像，需要以下幾個(gè)庫(kù)：pydicom、CV2、numpy、matplotlib。pydicom是專門處理dicom圖像的python專用包，numpy高效處理科學(xué)計(jì)算的包，依據(jù)數(shù)據(jù)繪圖的庫(kù)。
安裝需要的庫(kù)
pip install matplotlib
pip install opencv-python
pip install pydicom pip install numpy
安裝好這些庫(kù)后就可以對(duì)dicom文件操作了。
具體代碼如下：
#-*-coding:utf-8-*-
import cv2
import numpy
import dicom
from matplotlib import pyplot as plt
dcm = dicom.read_file("AT0001_100225002.DCM")
dcm.image = dcm.pixel_array * dcm.RescaleSlope + dcm.RescaleIntercept
slices = []
slices.append(dcm)
img = slices[ int(len(slices)/2) ].image.copy()
ret,img = cv2.threshold(img, 90,3071, cv2.THRESH_BINARY)
img = numpy.uint8(img)
im2, contours, _ = cv2.findContours(img,cv2.RETR_LIST,cv2.CHAIN_APPROX_SIMPLE)
mask = numpy.zeros(img.shape, numpy.uint8)
for contour in contours:
cv2.fillPoly(mask, [contour], 255)
img[(mask > 0)] = 255
kernel = cv2.getStructuringElement(cv2.MORPH_ELLIPSE,(2,2))
img = cv2.morphologyEx(img, cv2.MORPH_OPEN, kernel)
img2 = slices[ int(len(slices)/2) ].image.copy()
img2[(img == 0)] = -2000
plt.figure(figsize=(12, 12))
plt.subplot(131)
plt.imshow(slices[int(len(slices) / 2)].image, 'gray')
plt.title('Original')
plt.subplot(132)
plt.imshow(img, 'gray')
plt.title('Mask')
plt.subplot(133)
plt.imshow(img2, 'gray')
plt.title('Result')
plt.show()在DICOM圖像里，包含了患者的相關(guān)信息的字典，我們可以通過(guò)dir查看DICOM文件有什么信息，可以通過(guò)字典返回相關(guān)的值。
import dicom
import json
def loadFileInformation(filename):
information = {}
ds = dicom.read_file(filename)
information['PatientID'] = ds.PatientID
information['PatientName'] = ds.PatientName
information['PatientBirthDate'] = ds.PatientBirthDate
information['PatientSex'] = ds.PatientSex
information['StudyID'] = ds.StudyID
information['StudyDate'] = ds.StudyDate
information['StudyTime'] = ds.StudyTime
information['InstitutionName'] = ds.InstitutionName
information['Manufacturer'] = ds.Manufacturer
print dir(ds)
print type(information)
return information
a=loadFileInformation('AT0001_100225002.DCM')
print a關(guān)于python加載dicom圖片怎么實(shí)現(xiàn)就分享到這里了，希望以上內(nèi)容可以對(duì)大家有一定的幫助，可以學(xué)到更多知識(shí)。如果覺(jué)得文章不錯(cuò)，可以把它分享出去讓更多的人看到。
網(wǎng)站欄目：python加載dicom圖片怎么實(shí)現(xiàn)
文章出自：http://www.dlmjj.cn/article/psdces.html
