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在進(jìn)行生物信息學(xué)序列分析的過程中，NR（Non-Redundant）數(shù)據(jù)庫扮演著至關(guān)重要的角色。但是，這個(gè)數(shù)據(jù)庫的大小相當(dāng)巨大，所以在下載NR數(shù)據(jù)庫時(shí)，整個(gè)過程可以非常耗時(shí)。而當(dāng)你需要使用NR數(shù)據(jù)庫進(jìn)行一定的研究之后，相應(yīng)的解壓縮NR數(shù)據(jù)庫的過程也可能會(huì)涉及到一些技術(shù)難題。因此，在這篇文章中，我們將??重點(diǎn)介紹一些常規(guī)的nr數(shù)據(jù)庫解壓縮技巧和注意事項(xiàng)，幫助大家以快速且簡(jiǎn)單的方式來解壓NR數(shù)據(jù)庫。
目前創(chuàng)新互聯(lián)公司已為1000+的企業(yè)提供了網(wǎng)站建設(shè)、域名、虛擬主機(jī)、網(wǎng)站托管、服務(wù)器租用、企業(yè)網(wǎng)站設(shè)計(jì)、邢臺(tái)縣網(wǎng)站維護(hù)等服務(wù)，公司將堅(jiān)持客戶導(dǎo)向、應(yīng)用為本的策略，正道將秉承"和諧、參與、激情"的文化，與客戶和合作伙伴齊心協(xié)力一起成長(zhǎng)，共同發(fā)展。
之一步：下載NR數(shù)據(jù)庫
你需要在NCBI網(wǎng)站上下載NR數(shù)據(jù)庫。在Web瀏覽器中輸入“NCBI NR database”并單擊搜索按鈕，將會(huì)跳轉(zhuǎn)到NCBI NR數(shù)據(jù)庫的下載頁面。你會(huì)看到兩個(gè)下載文件：一個(gè)是壓縮文件“nr.gz”，另一個(gè)是實(shí)體（Binary）碎片文件，其文件名為“nr”的多個(gè)擴(kuò)展名。
第二步：解壓縮NR.gz文件
NR.gz文件是NR數(shù)據(jù)庫的壓縮文件，因此，需要使用一些解壓工具將其解壓。對(duì)于Unix/Lunix/Mac用戶，可以直接使用命令行工具，如“gunzip”，來解壓縮NR.gz文件。如果你是Windows用戶，則可以使用WinRAR、WinZip或7Zip等常見解壓縮工具來完成解壓任務(wù)。
讓我們以7Zip為例，演示一下如何解壓NR.gz文件。你需要將NR.gz文件移動(dòng)到你計(jì)算機(jī)的任何目錄中。右鍵單擊NR.gz文件，選擇“7-Zip”菜單，接著再選擇“7-Zip”小菜單中的“在此處解壓縮”，即可開始解壓縮NR.gz文件。完成后，會(huì)在同一目錄下生成一個(gè)“nr”文件。
第三步：合并碎片文件
在你解壓NR.gz文件的同時(shí)，你也必須合并文件名為“nr”的多個(gè)碎片文件。你可以將這些碎片文件繼續(xù)使用7Zip、WinRAR或其他合并工具進(jìn)行合并。合并完成后，將生成一個(gè)大文件，即為NR數(shù)據(jù)庫。
第四步：準(zhǔn)備BLAST環(huán)境
一旦NR數(shù)據(jù)庫被解壓縮和合并成一個(gè)大文件，你就可以開始在你的生物信息學(xué)分析流程中使用它了。不過，在之前，你需要準(zhǔn)備好BLAST（Basic Local Alignment Search Tool）環(huán)境。BLAST是一款廣泛應(yīng)用于序列分析工具中的軟件，用于比對(duì)和分析特定序列。
在使用BLAST進(jìn)行NR數(shù)據(jù)庫的搜索之前，你需要先下載BLAST，然后通過配置文件為其指定NR數(shù)據(jù)庫文件路徑。另外，在使用BLAST搜索NR數(shù)據(jù)庫之前，還應(yīng)該了解如何編寫一個(gè)BLAST查詢。
NR數(shù)據(jù)庫的解壓縮過程可能會(huì)涉及到一些技術(shù)難題，但只要你了解了基本操作，就可以在短時(shí)間內(nèi)簡(jiǎn)單地完成它。在這篇文章中，我們介紹了NR.gz文件的解壓縮方法、碎片文件的合并方法以及BLAST的安裝和配置。不愧是這種常用的解壓縮任務(wù)，請(qǐng)不要感到陌生或不安，相信您的科學(xué)精神和實(shí)踐經(jīng)驗(yàn)定會(huì)越發(fā)豐富！
相關(guān)問題拓展閱讀：
- linux安裝oracle11g
- sql2023數(shù)據(jù)庫壓縮備份影響數(shù)據(jù)嗎
linux安裝oracle11g
我看像是安裝文件路徑有中文造成的，安裝包位置路徑不能有中文
因項(xiàng)目需求，需要在64位linux系統(tǒng)中安裝Oracle 11g，在網(wǎng)上查了很多內(nèi)容，結(jié)合自己的實(shí)際經(jīng)驗(yàn)，終于安裝成功，記錄下來，分享給有需要的同志們，不謝哈！^_^
一、修改操作系統(tǒng)核心參數(shù)
在Root用戶下執(zhí)行以下步驟：
1）修改用戶的SHELL的限制，修改/etc/security/limits.conf文件
輸入命令：vi /etc/security/limits.conf，按i鍵進(jìn)入編輯模式，將下列內(nèi)容加入該文件。
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oracle soft nproc 2023
oracle hard nproc 16384
oracle soft nofile 1024
oracle hard nofile 65536
編輯完成后按Esc鍵，輸入“:wq”存盤退出
2）修改/etc/pam.d/login 文件，輸入命令：vi /etc/pam.d/login，按i鍵進(jìn)入編輯模式，將下列內(nèi)容加入該文件。
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session required /lib/security/pam_limits.so
session required pam_limits.so
編輯完成后按Esc鍵，輸入“:wq”存盤退出
3）修改linux內(nèi)核，修改/etc/sysctl.conf文件，輸入命令: vi /etc/sysctl.conf ，按i鍵進(jìn)入編輯模式，將下列內(nèi)容加入該文件
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fs.file-max =
fs.aio-max-nr =
kernel.shmall =
kernel.shmmax =
kernel.shmmni = 4096
kernel.sem = 128
net.ipv4.ip_local_port_range =
net.core.rmem_default =
net.core.rmem_max =
net.core.wmem_default =
net.core.wmem_max =
編輯完成后按Esc鍵，輸入“:wq”存盤退出
4）要使 /etc/sysctl.conf 更改立即生效，執(zhí)行以下命令。 輸入：sysctl -p 顯示如下：
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linux:~ # sysctl -p
net.ipv4.icmp_echo_ignore_broadcasts = 1
net.ipv4.conf.all.rp_filter = 1
fs.file-max =
fs.aio-max-nr =
kernel.shmall =
kernel.shmmax =
kernel.shmmni = 4096
kernel.sem = 128
net.ipv4.ip_local_port_range =
net.core.rmem_default =
net.core.rmem_max =
net.core.wmem_default =
net.core.wmem_max =
5）編輯 /etc/profile ，輸入命令：vi /etc/profile，按i鍵進(jìn)入編輯模式，將下列內(nèi)容加入該文件。
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if ; then
if ; then
ulimit -p 16384
ulimit -n 65536
else
ulimit -un 65536
fi
fi
編輯完成后按Esc鍵，輸入“:wq”存盤退出
6）創(chuàng)建相關(guān)用戶和組，作為軟件安裝和支持組的擁有者。
創(chuàng)建Oracle用戶和密碼,輸入命令：
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useradd -g oinstall -g dba -m oracle
passwd oracle
然后會(huì)讓你輸入密碼，密碼任意輸入2次，但必須保持一致，回車確認(rèn)。
7）創(chuàng)建數(shù)據(jù)庫軟件目錄和數(shù)據(jù)文件存放目錄，目錄的位置，根據(jù)自己的情況來定，注意磁盤空間即可，這里我把其放到oracle用戶下,例如：
輸入命令：
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mkdir /home/oracle/app
mkdir /home/oracle/app/oracle
mkdir /home/oracle/app/oradata
mkdir /home/oracle/app/oracle/product
8)更改目錄屬主為Oracle用戶所有，輸入命令：
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chown -R oracle:oinstall /home/oracle/app
9)配置oracle用戶的環(huán)境變量，首先，切換到新創(chuàng)建的oracle用戶下,
輸入：su – oracle ，然后直接在輸入 ： vi .bash_profile
按i編輯 .bash_profile,進(jìn)入編輯模式，增加以下內(nèi)容：
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export ORACLE_BASE=/home/oracle/app
export ORACLE_HOME=$ORACLE_BASE/oracle/product/11.2.0/dbhome_1
export ORACLE_SID=orcl
export PATH=$PATH:$HOME/bin:$ORACLE_HOME/bin
export LD_LIBRARY_PATH=$ORACLE_HOME/lib:/usr/lib
編輯完成后按Esc鍵，輸入“:wq”存盤退出
二、安裝過程
1）當(dāng)上述系統(tǒng)要求操作全部完成后，注銷系統(tǒng)，在圖形界面以O(shè)racle用戶登陸。首先將下載的Oracle安裝包復(fù)制到linux中，用SSH其他ftp工具拷貝。
打開一個(gè)終端，運(yùn)行unzip命令解壓oracle安裝文件，如：
輸入命令：
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unzip linux.x64_11gR2_database_1of2.zip
unzip linux.x64_11gR2_database_2of2.zip
解壓完成后 cd 進(jìn)入其解壓后的目錄database
輸入命令：
cd database
使用ls命令可以查看解壓后database所包含的文件，如下圖：
2）執(zhí)行安裝，輸入命令：./runInstaller
裝到這一步，可以看到，可以查看到有很多的rpm包沒有，我們可以從安裝linux的光盤或ISO中（或去D:\linux_oracle11g_Package）查找所缺的包，使用ftp上傳到linux中，然后使用rpm –ivh xxx.rpm –nodeps –force 來進(jìn)行安裝（其中加上–nodeps — force 代表強(qiáng)制安裝，是在直接使用rpm –ivh xxx.rpm安裝不成功的情況下用的）等到把包全部都安裝好的情況下，再次在oracle圖形界面中，執(zhí)行安裝過程2，下來在環(huán)境檢查過程中，就通過了。
安裝過程中86%可能會(huì)遇到報(bào)錯(cuò)如出錯(cuò)問題（error in invoking target ‘mkldflags ntcontab.o nnfgt.o’ of makefile）按照如下步驟順序執(zhí)行。
上傳安裝鏡像rhel-server-6.1-x86_64-dvd.iso，
然后將鏡像文件掛，如/mnt
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# mount -o loop rhel-server-6.1-x86_64-dvd.iso /mnt
# cd /mnt/Packages
# rpm -ivh glibc-common-2.12-1.25.el6.x86_64.rpm
# rpm -ivh kernel-headers-2.6.32-131.0.15.el6.x86_64.rpm
# rpm -ivh libgcc-4.4.5-6.el6.x86_64.rpm
# rpm -ivh glibc-2.12-1.25.el6.x86_64.rpm
# rpm -ivh libgomp-4.4.5-6.el6.x86_64.rpm
# rpm -ivh nscd-2.12-1.25.el6.x86_64.rpm
# rpm -ivh glibc-headers-2.12-1.25.el6.x86_64.rpm
# rpm -ivh glibc-devel-2.12-1.25.el6.x86_64.rpm
# rpm -ivh mpfr-2.4.1-6.el6.x86_64.rpm
# rpm -ivh ppl-0.10.2-11.el6.x86_64.rpm
# rpm -ivh cloog-ppl-0.15.7-1.2.el6.x86_64.rpm
# rpm -ivh cpp-4.4.5-6.el6.x86_64.rpm
# rpm -ivh gcc-4.4.5-6.el6.x86_64.rpm
注：以上是安裝gcc，軟件安裝順序不能錯(cuò)。
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# rpm -ivh libstdc++-4.4.5-6.el6.x86_64.rpm
# rpm -ivh libstdc++-devel-4.4.5-6.el6.x86_64.rpm
# rpm -ivh gcc-c++-4.4.5-6.el6.x86_64.rpm
注：以上是安裝gcc-c++
根據(jù)這個(gè)方法解決了錯(cuò)誤。
安裝完成后，系統(tǒng)會(huì)提示你需要用root權(quán)限執(zhí)行2個(gè)shell腳本。按照其提示的路徑，找到其所在的位置，如：我的就在/home/oracle/app/oracle/product/11.2.0/dbhome_1/root.sh
和 /home/oracle/oraInventory/orainstRoot.sh 新開啟一個(gè)終端，輸入命令：
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su – root
cd /home/oracle/app/oracle/product/11.2.0/dbhome_1
sh root.sh
cd /home/oracle/oraInventory
sh orainstRoot.sh
三、數(shù)據(jù)庫建庫
1） 還是在oracle用戶的圖形界面oracle用戶中，新開啟一個(gè)終端，直接輸入命令dbca會(huì)彈出如下界面。我們這里采用定制數(shù)據(jù)庫。
有兩個(gè)zip壓縮包，把2of2的components里的東西拷貝到1of2的components里就行了，我也遇到過！
權(quán)限問題。文件權(quán)限。目錄權(quán)限
是不是你空間不足了，用df看下各盤的使用情況，要不正常只要安裝就沒多大問題了
再者建議在英文環(huán)境下安裝
sql2023數(shù)據(jù)庫壓縮備份影響數(shù)據(jù)嗎
SQL Server 2023 中的數(shù)據(jù)庫壓縮備份不會(huì)影響數(shù)據(jù)，因?yàn)閴嚎s備份本質(zhì)上是在將備份文件進(jìn)行壓縮，而不是備份數(shù)據(jù)庫時(shí)對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行壓縮。所以，壓縮備份對(duì)數(shù)據(jù)本身沒有任何影響。
壓縮備份可以有效地減小備份文件的大小，減少磁盤占用空間，并且在數(shù)據(jù)傳輸過程中可以加快數(shù)據(jù)傳輸速度。此外，壓縮備份也可以提高備份的效率，使得備份時(shí)間更短。
需要注意的是，雖然備份文件壓縮可以減小文件大小，但是對(duì)于大型數(shù)據(jù)庫來說，壓縮備份可能會(huì)占用更多的 CPU 和內(nèi)存資源，因此需要在備份時(shí)謹(jǐn)慎選擇壓縮備份選項(xiàng)。
總之，SQL Server 2023 中的數(shù)據(jù)庫壓縮備份不會(huì)影響數(shù)據(jù)本身，可以有效地減小備份文件大小，提高備份效率，并且需要謹(jǐn)慎選擇壓縮備份選項(xiàng)，以免占用過多的資源。
答案：壓縮備份會(huì)影響數(shù)據(jù)庫，具體影響取決于壓縮比率和壓縮方式。壓縮備份會(huì)減小備份文件的大小，節(jié)省磁盤空間和傳輸時(shí)間，但同時(shí)也會(huì)增加備份和還原的時(shí)間和 CPU 資源消耗。因此，在進(jìn)行壓縮備份時(shí)，需要根據(jù)實(shí)際情況權(quán)衡利弊，選擇合適的壓縮比率和壓縮方式，以達(dá)到更好的備份效果和性能。
解釋：在 SQL Server 2023 中，可以使用壓縮備份選項(xiàng)來壓縮備份文件，以減小備份文件的大小。壓縮備份有兩種方式：逐頁壓縮和逐行壓縮。逐頁壓縮是默認(rèn)的壓縮方式，它可以顯著減小備份文件的大小，但會(huì)增加備份和還原的時(shí)間和 CPU 資源消耗。逐行壓縮可以更加精細(xì)地控制壓縮比率，但需要在備份命令中指定 WITH COMPRESSION 參數(shù)。需要注意的是，壓縮備份并不適用于所有類型的數(shù)據(jù)庫，對(duì)于已經(jīng)高度壓縮或包含大量 LOB 數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)庫，壓縮備份可能并不會(huì)帶來明顯的效果。
拓展：除了壓縮備份，SQL Server 還提供了多種備份和還原選項(xiàng)，如完整備份、差異備份、日志備份等。在進(jìn)行備份和還原時(shí)，需要根據(jù)實(shí)際情況選擇合適的選項(xiàng)和策略，以保證數(shù)據(jù)的安全性和可恢復(fù)性。同時(shí)，還需要定期測(cè)試備份和還原方案的有效性，以應(yīng)對(duì)突發(fā)事件和故障。
數(shù)據(jù)庫壓縮備份對(duì)數(shù)據(jù)的影響取決于壓縮備份的具體方式。如果采用的是在線壓縮備份方式，即不會(huì)影響數(shù)據(jù)庫的正常運(yùn)行，同時(shí)在備份時(shí)壓縮數(shù)據(jù)文件，以減小備份文件的大小，這種方式不會(huì)對(duì)數(shù)據(jù)造成影響。因此，不必?fù)?dān)心備份的數(shù)據(jù)完整性和正確性。
但是，在線壓縮備份需要較多的 CPU 和內(nèi)存資源，如果服務(wù)器資源不足，則會(huì)影響數(shù)據(jù)庫的性能，從而影響數(shù)據(jù)的使用。此外，備份文件在壓縮后會(huì)占用更少的存儲(chǔ)空間，但是在還原備份文件時(shí)需要更長(zhǎng)的時(shí)間，因?yàn)樾枰鈮嚎s備份文件。因此，需要權(quán)衡備份文件的大小和還原備份文件所需的時(shí)間。
另外，如果采用的是離線壓縮備份方式，即需要先停止數(shù)據(jù)庫的運(yùn)行，備份數(shù)據(jù)文件并將其壓縮，此時(shí)對(duì)數(shù)據(jù)庫會(huì)產(chǎn)生停機(jī)的影響，可能會(huì)影響數(shù)據(jù)的完整性和正確性。因此，在選擇備份方式時(shí)，需要根據(jù)實(shí)際情況進(jìn)行權(quán)衡和選擇。
需要注意的是，采用壓縮備份方式時(shí)，應(yīng)該定期進(jìn)行備份文件的校驗(yàn)和恢復(fù)測(cè)試，以確保備份數(shù)據(jù)的正確性和可用性。
SQL Server 2023 數(shù)據(jù)庫壓縮備份不會(huì)影響數(shù)據(jù)的完整性和一致性。壓縮備份僅僅是對(duì)備份數(shù)據(jù)進(jìn)行壓縮，減少備份數(shù)據(jù)的存儲(chǔ)空間，不會(huì)對(duì)備份數(shù)據(jù)本身進(jìn)行修改或刪除，因此不會(huì)對(duì)數(shù)據(jù)的完整性和一致性造成影響。
壓縮備份的好處是可以節(jié)約大量的磁盤空間，同時(shí)也可以提高備份和恢復(fù)的速度。但是需要注意的是，壓縮備份需要更多的 CPU 和內(nèi)存資源，因此可能會(huì)影響系統(tǒng)的性能。此外，對(duì)于大型數(shù)據(jù)庫，壓縮備份可能需要更長(zhǎng)的時(shí)間來完成。因此，在進(jìn)行壓縮備份之前，需要對(duì)系統(tǒng)資源和備份時(shí)間進(jìn)行充分的評(píng)估和計(jì)劃。
總之，SQL Server 2023 數(shù)據(jù)庫壓縮備份不會(huì)影響數(shù)據(jù)的完整性和一致性，但需要注意對(duì)系統(tǒng)資源和備份時(shí)間進(jìn)行評(píng)估和規(guī)劃，以確保系統(tǒng)的穩(wěn)定性和備份的可靠性。
SQL Server 2023 數(shù)據(jù)庫的壓縮備份不會(huì)影響數(shù)據(jù)，因?yàn)樗皇菍?duì)備份文件進(jìn)行了壓縮，對(duì)數(shù)據(jù)庫本身的數(shù)據(jù)沒有影響。壓縮備份可以減小備份文件的大小，節(jié)省磁盤空間，提高備份文件的傳輸效率。壓縮備份可以通過 SQL Server Management Studio 或者 Transact-SQL 語句來實(shí)現(xiàn)。在進(jìn)行壓縮備份時(shí)，需要注意的是，壓縮備份需要更多的 CPU 和內(nèi)存資源，備份時(shí)間也會(huì)更長(zhǎng)。如果備份非常大，壓縮備份會(huì)增加還原的時(shí)間。因此，需要根據(jù)實(shí)際情況來選擇是否進(jìn)行壓縮備份。同時(shí)，還需要注意備份文件的保存位置，以免備份文件丟失導(dǎo)致數(shù)據(jù)無法還原。
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網(wǎng)頁題目：NR數(shù)據(jù)庫解壓縮教程：快速簡(jiǎn)單搞定！ (nr數(shù)據(jù)庫解壓縮)
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