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隨著科技的不斷進(jìn)步，數(shù)據(jù)變得越來越重要，尤其是在企業(yè)內(nèi)部數(shù)據(jù)的管理與應(yīng)用。隨著數(shù)據(jù)量的增長，傳統(tǒng)的數(shù)據(jù)庫管理系統(tǒng)也出現(xiàn)了一些限制。為了充分利用數(shù)據(jù)資源，提高數(shù)據(jù)管理效率和質(zhì)量，數(shù)據(jù)庫技術(shù)不斷推陳出新。其中一個值得關(guān)注的新技術(shù)就是rc數(shù)據(jù)庫。
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數(shù)據(jù)庫rc，全稱為Relational Cloud，是一種新型的分布式數(shù)據(jù)庫管理系統(tǒng)，可以自動進(jìn)行負(fù)載均衡、高可用性、水平擴(kuò)容和在線索引等操作。下面將從以下幾個方面來詳細(xì)探討一下數(shù)據(jù)庫rc的特點和優(yōu)勢。
1.分布式架構(gòu)
傳統(tǒng)的關(guān)系型數(shù)據(jù)庫主要是單機(jī)環(huán)境下工作的。但隨著企業(yè)業(yè)務(wù)量的不斷增長，數(shù)據(jù)量也急劇增加，單機(jī)環(huán)境已經(jīng)不能滿足業(yè)務(wù)需要，需要采用分布式架構(gòu)來進(jìn)行數(shù)據(jù)管理。rc數(shù)據(jù)庫采用分布式架構(gòu)，將數(shù)據(jù)分片存儲，并進(jìn)行負(fù)載均衡，可以提高數(shù)據(jù)庫的負(fù)載能力，保證數(shù)據(jù)的高可用性和可靠性。
2.自動水平擴(kuò)容
rc數(shù)據(jù)庫可以自動水平擴(kuò)容。當(dāng)數(shù)據(jù)量增加時，可以通過自動添加數(shù)據(jù)節(jié)點的方式來擴(kuò)容，同時還可以保證負(fù)載均衡和高可用性。這一點不僅減輕了數(shù)據(jù)庫管理員的工作量，也提高了數(shù)據(jù)庫的拓展性。
3.在線索引
rc數(shù)據(jù)庫采用在線索引技術(shù)，可以保證數(shù)據(jù)查詢的高效性。在線索引可以確保在大型數(shù)據(jù)集上進(jìn)行高效的插入、更新和刪除操作，從而提高數(shù)據(jù)的寫入和讀取速度。與傳統(tǒng)數(shù)據(jù)庫的索引方式不同，rc數(shù)據(jù)庫的索引是動態(tài)生成的，而且不會阻塞數(shù)據(jù)操作。這種索引方式可以避免數(shù)據(jù)庫鎖的問題，提高數(shù)據(jù)的并發(fā)性。
4.支持多租戶模式
rc數(shù)據(jù)庫采用多租戶模式，可以使不同業(yè)務(wù)的數(shù)據(jù)進(jìn)行隔離。在多租戶模式下，不同業(yè)務(wù)之間的數(shù)據(jù)可以互不干擾的使用，從而保證數(shù)據(jù)的安全性。
5.數(shù)據(jù)安全
rc數(shù)據(jù)庫可以為企業(yè)提供高級的數(shù)據(jù)安全保障，包括數(shù)據(jù)加密、數(shù)據(jù)備份和數(shù)據(jù)恢復(fù)等功能。對于一些敏感的數(shù)據(jù)，rc數(shù)據(jù)庫可以用加密的方式存儲，避免數(shù)據(jù)泄露的風(fēng)險。同時rc數(shù)據(jù)庫還支持?jǐn)?shù)據(jù)備份和恢復(fù)功能，以便在系統(tǒng)發(fā)生故障時可以快速恢復(fù)數(shù)據(jù)，保證數(shù)據(jù)的完整性和可靠性。
rc數(shù)據(jù)庫是一種非常先進(jìn)的新型數(shù)據(jù)庫管理技術(shù)，可以幫助企業(yè)實現(xiàn)數(shù)據(jù)分布式管理、高效數(shù)據(jù)查詢、自動水平擴(kuò)容、在線索引以及多租戶模式等功能，從而提高企業(yè)數(shù)據(jù)的質(zhì)量和效率，為企業(yè)業(yè)務(wù)的發(fā)展提供堅實可靠的基礎(chǔ)。
成都網(wǎng)站建設(shè)公司-創(chuàng)新互聯(lián),建站經(jīng)驗豐富以策略為先導(dǎo)10多年以來專注數(shù)字化網(wǎng)站建設(shè),提供企業(yè)網(wǎng)站建設(shè),高端網(wǎng)站設(shè)計,響應(yīng)式網(wǎng)站制作,設(shè)計師量身打造品牌風(fēng)格,熱線:028-86922220高通量測序數(shù)據(jù)公共數(shù)據(jù)庫有哪些(高通量測序常規(guī))
GenBank數(shù)據(jù)庫結(jié)構(gòu)
完整的GenBank數(shù)據(jù)庫包括序列文件，索引文件以及其它有關(guān)文件。索引文件是根據(jù)數(shù)據(jù)庫中作者、參考文枝蘆亂獻(xiàn)等建立的，用于數(shù)據(jù)庫查詢。GenPept是由GenBank中的核酸序列翻譯而得到的蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫，其數(shù)據(jù)格式為FastA。
GenBank中最常用的是序列文件。序列文件的基本單位是序列條目，包括核苷酸堿基排列順序和注釋兩部分。目前，許多生物信息資源中心通過計算機(jī)網(wǎng)絡(luò)提供該數(shù)據(jù)庫文件。下面，我們介紹序列文件的結(jié)構(gòu)。
GenBank序列文件由單個的序列條目組成。序列條目由字段組成，每個字段由關(guān)鍵字起始，后面為該字段的具體說明。有些字段又分若干次子字段，以次關(guān)鍵字或特性表說明符開始。每個序列條目以雙斜杠“//”作結(jié)束標(biāo)記。序列條目的格式非常重要，關(guān)鍵字從之一列開始，次關(guān)鍵字從第三列開始，特性表說明符從第五列開始。每個字段可以占一行，也可以占若干行。若一行中寫不下時，繼續(xù)行以空格開始。
序列條目的關(guān)鍵字包括LOCUS(代碼)，DEFINITION(說明)，ACCESSION(編號)，NID符(核酸標(biāo)識)，KEYWORDS(關(guān)鍵詞)，SOURCE(數(shù)據(jù)來源)，REFERENCE(文獻(xiàn))，F(xiàn)EATURES(特性表)，BASECOUNT(堿基組成)及ORIGIN(堿基排列順序)。先版的核酸序列數(shù)據(jù)庫將引入新的關(guān)鍵詞SV(序列版本號)，用“編號.版本號”表示，并取代關(guān)鍵詞NID。
LOCUS(代碼)：是該序列條目的標(biāo)記，或者說標(biāo)識符，蘊涵這個序列的功能。例如，圖4.1中所示的HUMCYCLOX表示人的環(huán)氧化酶。該字段還包括其它相關(guān)內(nèi)容，如序列長度、類型、種屬來源以及錄入日期等。說明字段是有關(guān)這一序列的簡單描述，如本例為人環(huán)氧化酶-2的mRNA全序列。
ACCESSION(編號)：具有唯一性和永久性，如本例中代碼M90100用來表示上述人環(huán)氧化酶-2的mRNA序列，在文獻(xiàn)中引用這個序列時嘩茄，應(yīng)該以此編號為準(zhǔn)。
KEYWORDS(關(guān)鍵詞)字段：由該序列的提交者提供，包括該序列的基因產(chǎn)物以及其它相關(guān)信息，如本例中環(huán)氧化酶-2(-2)，前列腺素合成酶(synthase)。
SOURCE(數(shù)據(jù)來源)字段：說明該序列是從什么生物體、什么組織得到的，如本例中人臍帶血(umbilicalvein)。次關(guān)鍵字ORGANI(種屬)指出該生物體的分類學(xué)地位，如本例人、真核生物等等(詳見圖4.1)。
REFERENCE(文獻(xiàn))字段：說明該序列中的相關(guān)文獻(xiàn)，包括AUTHORS(作者)，TITLE(題目)及JOURNAL(雜志名)等，以次關(guān)鍵詞列出。該字段中還列出醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)摘要數(shù)據(jù)庫MEDLINE的代碼。該代碼實際上是個超文本鏈接，點擊它可以直接調(diào)用上述文獻(xiàn)摘要。一個序列可以有多篇文獻(xiàn)，以不同序號表示，并給出該序列中的哪一部分與文獻(xiàn)有關(guān)。
FEATURES(特性表)：具有特定的格式，用來詳細(xì)描述序列特性。特性表中帶有‘/db-xref/’標(biāo)志的字符可以連接到其它數(shù)據(jù)庫，如本例中的分類數(shù)據(jù)庫（taxon9606），以及蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫（PID：g181254）。序列中各部分的位置都在表中標(biāo)明，5’非編碼區(qū)(1-97)，編碼區(qū)()，3’非編碼區(qū)()，多聚腺苷酸重復(fù)區(qū)域()，等等。翻譯所得信號肽以及最終蛋白質(zhì)產(chǎn)物也都有所說明。當(dāng)然，這個例子只是特性表的部分注釋信息，但已經(jīng)足以說明其詳細(xì)程度。
接下來是堿基含量字段，給出序列中的堿組成，如本例中1010個A，712個C，633個G，1032個T。ORIGIN行是序列的引導(dǎo)行，接下來便是堿基序列，以雙斜杠行“//”結(jié)束。
·EMBL數(shù)據(jù)庫結(jié)構(gòu)
EMBL數(shù)據(jù)庫的基本單位也是序列條目，包括核甘酸堿基排列順序和注釋兩部分。序列條目由字段組成，每個字段由標(biāo)識字起始，后面為該字段的具體說明。有些字段又分若干次子字段，以次標(biāo)識字或特性表說明符開始，最后以雙斜杠“//”作本序列條目結(jié)束標(biāo)記。
條目的關(guān)鍵字包括ID（序列名稱），DE（序列簡單說明），AC（序列編號），SV（序列版本號），KW（與序列相關(guān)的關(guān)鍵詞），OS（序列來源的物種名），OC（序列來源的物種學(xué)名和分類學(xué)位置），RN（相關(guān)文獻(xiàn)編號或遞交序列的注冊信息），RA（相關(guān)文獻(xiàn)作者或遞交序列的作者），RT（相關(guān)文獻(xiàn)題目），RL（相關(guān)猛檔文獻(xiàn)雜志名或遞交序列的作者單位），RX（相關(guān)文獻(xiàn)Mediline引文代碼），RC（相關(guān)文獻(xiàn)注釋），RP（相關(guān)文獻(xiàn)其他注釋），CC（關(guān)于序列的注釋信息），DR（相關(guān)數(shù)據(jù)庫交叉引用號），F(xiàn)H（序列特征表起始），F(xiàn)T（序列特征表子項），SQ（堿基種類統(tǒng)計數(shù)）。
其它常用核酸序列數(shù)據(jù)庫
·dbEST
dbEST數(shù)據(jù)庫專門收集EST數(shù)據(jù)，該數(shù)據(jù)庫有自己的格式，包括識別符、代碼、序列數(shù)據(jù)以及dbEST的注釋摘要，也按DNA的種類分成了若干子數(shù)據(jù)庫。1998年5月8日版的dbEST共包括1.6_106條EST。其中有1百萬條人的EST，30萬條小鼠和大鼠的EST。
·GSDB
GSDB是基因組序列數(shù)據(jù)庫（GenomeSequenceDataBase），由美國新墨西哥州SantaFe的國家基因組資源中心創(chuàng)建。GSDB收集、管理并且發(fā)布完整的DNA序列及其相關(guān)信息，以滿足基因組測序中心需要。該數(shù)據(jù)庫采用服務(wù)器-客戶機(jī)關(guān)系數(shù)據(jù)庫模式，大規(guī)模測序機(jī)構(gòu)可以通過計算機(jī)網(wǎng)絡(luò)向服務(wù)器提交數(shù)據(jù)，并在發(fā)送之前對數(shù)據(jù)進(jìn)行檢查，以確保數(shù)據(jù)的質(zhì)量。
GSDB數(shù)據(jù)庫中條目的格式與GenBank中的基本一致，主要區(qū)別是GSDB數(shù)據(jù)庫中增加了GSDBID識別符。
GSDB數(shù)據(jù)庫可以通過萬維網(wǎng)查詢，也可以使用服務(wù)器-客戶機(jī)關(guān)系數(shù)據(jù)庫方式查詢。無論用哪種方法，熟悉數(shù)據(jù)庫結(jié)構(gòu)化查詢語言SQL，對更好地使用GSDB數(shù)據(jù)庫會有所幫助。
·UniGene
人類基因組計劃的首要任務(wù)是對人類基因組進(jìn)行全序列測定，整個基因組估計有30億個堿基對，其中大約3%可以編碼蛋白質(zhì)，其余部分的生物學(xué)功能還不清楚。轉(zhuǎn)錄圖譜可以把基因組中能夠編碼蛋白質(zhì)的部分集中起來，因此是一種重要的數(shù)據(jù)資源。
UniGene試圖通過計算機(jī)程序?qū)eneBank中的序列數(shù)據(jù)進(jìn)行適當(dāng)處理，剔除冗余部分，將同一基因的序列，包括EST序列片段搜集到一起，以便研究基因的轉(zhuǎn)錄圖譜。UniGene除了包括人的基因外，也包括小鼠、大鼠等其它模式生物的基因，而下一章將要介紹的HGI數(shù)據(jù)庫只包括人的基因。該數(shù)據(jù)庫的標(biāo)題行（TITLE）給出基因的名稱和簡單說明，表達(dá)部位行（EXPRESS）指出該基因在什么組織中表達(dá)以及在基因圖譜中的位置等。此外，列出該基因在核酸序列數(shù)據(jù)庫GenBank或EMBL和蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫SWISS-PROT中的編號的超文本鏈接。
UniGene中部分條目包括已知基因序列，而有些條目則僅有新測得的EST序列片段。這就意味著，這些EST序列所對應(yīng)的基因尚未搞清，可以用來發(fā)現(xiàn)新基因。在描繪基因圖譜及大規(guī)?；虮磉_(dá)分析等研究中，UniGene也可以幫助實驗設(shè)計者選擇試劑。
UniGene可以通過NCBI或SRS系統(tǒng)訪問
關(guān)于數(shù)據(jù)庫rc的介紹到此就結(jié)束了，不知道你從中找到你需要的信息了嗎 ？如果你還想了解更多這方面的信息，記得收藏關(guān)注本站。
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文章名稱：探秘數(shù)據(jù)庫rc：了解數(shù)據(jù)管理的新概念(數(shù)據(jù)庫rc)
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