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微生物檢測(cè):數(shù)據(jù)庫賦能讓分析更精準(zhǔn)(微生物檢測(cè)中的數(shù)據(jù)庫)

微生物檢測(cè)是指對(duì)生物體外界或內(nèi)部環(huán)境中的微生物進(jìn)行鑒定和分析的一種方法,其包括對(duì)樣品進(jìn)行樣品采集、處理、富集、分離等步驟,以及對(duì)微生物菌株的鑒定和分析。

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隨著科技的發(fā)展,微生物檢測(cè)也得到了極大的發(fā)展,其中數(shù)據(jù)庫技術(shù)的發(fā)展,對(duì)微生物檢測(cè)的準(zhǔn)確性和精度提高功不可沒。

一、微生物檢測(cè)的意義

微生物檢測(cè)主要應(yīng)用于醫(yī)療、公共衛(wèi)生、食品工業(yè)、水處理等領(lǐng)域,其主要目的是為了保障公眾的身體健康、食品質(zhì)量安全以及環(huán)境衛(wèi)生。

例如,在醫(yī)療領(lǐng)域,微生物檢測(cè)可以幫助醫(yī)生快速確定患者的病因,以便更好地進(jìn)行治療,保障患者的生命安全。在食品工業(yè)領(lǐng)域,微生物檢測(cè)可以幫助企業(yè)合理控制菌群,確保食品產(chǎn)品的質(zhì)量安全。

二、微生物檢測(cè)的方法

微生物檢測(cè)的方法主要包括傳統(tǒng)方法和現(xiàn)代方法。傳統(tǒng)方法主要是通過對(duì)樣品進(jìn)行培養(yǎng)、分離、鑒定等步驟,以統(tǒng)計(jì)分析的方式來獲取微生物信息。

現(xiàn)代方法則更加側(cè)重于使用分子生物學(xué)技術(shù)準(zhǔn)確快速地獲取微生物信息。包括PCR、熒光原位雜交(FISH)、DNA芯片等技術(shù),可以快速地將微生物菌株進(jìn)行鑒定和分類,同時(shí)能夠利用生物信息學(xué)技術(shù)進(jìn)一步進(jìn)行分析。

三、數(shù)據(jù)庫賦能微生物檢測(cè)的意義

在微生物檢測(cè)中,準(zhǔn)確而精細(xì)的數(shù)據(jù)庫是必不可少的?;跀?shù)據(jù)庫和數(shù)據(jù)挖掘技術(shù),微生物檢測(cè)可以更加全面地了解和掌握。

具體而言,數(shù)據(jù)庫賦能微生物檢測(cè),可以幫助微生物檢測(cè)實(shí)現(xiàn)以下幾個(gè)方面的提升:

1. 提升檢測(cè)效率

基于數(shù)據(jù)庫,檢測(cè)人員可以快速精確地獲取微生物信息,并對(duì)其進(jìn)行分析。與傳統(tǒng)的檢測(cè)方法相比,數(shù)據(jù)庫技術(shù)能夠大幅度提高檢測(cè)效率,同時(shí)還可以提高測(cè)試覆蓋率,從而實(shí)現(xiàn)更高的檢測(cè)精度。

2. 提升品質(zhì)保障水平

通過數(shù)據(jù)庫技術(shù),檢測(cè)員可以實(shí)時(shí)了解樣品的檢測(cè)歷史和檢測(cè)結(jié)果,檢測(cè)員甚至可以通過應(yīng)用水印、身份證等信息來保障數(shù)據(jù)的可靠性和數(shù)字化。這樣既可以提高檢測(cè)質(zhì)量和合規(guī)性,也可以更大程度避免數(shù)據(jù)造假的風(fēng)險(xiǎn),為廣大消費(fèi)者保障食品安全提供更可靠的手段。

3. 提升檢測(cè)精度

微生物檢測(cè)本質(zhì)上是一種數(shù)據(jù)分析,檢測(cè)數(shù)據(jù)的多元化和豐富性是提高檢測(cè)精度的前提。數(shù)據(jù)庫技術(shù)將大量、多樣的數(shù)據(jù)統(tǒng)一整理、擴(kuò)充和分類存儲(chǔ),從而能夠充分利用模式識(shí)別、數(shù)據(jù)挖掘等技術(shù)進(jìn)行更加精準(zhǔn)地檢測(cè)分析。

四、數(shù)據(jù)庫在微生物檢測(cè)中的應(yīng)用

近年來,數(shù)據(jù)庫在微生物檢測(cè)中得到了廣泛應(yīng)用,包括月球上的微生物檢測(cè)等一些大型復(fù)雜的項(xiàng)目。

1. 技術(shù)進(jìn)步

在微生物檢測(cè)技術(shù)與數(shù)據(jù)庫相結(jié)合后,數(shù)據(jù)的抽樣和存儲(chǔ)、結(jié)果的分析、投資的管控以及數(shù)據(jù)的共享等各個(gè)環(huán)節(jié)可靠性更高、準(zhǔn)確性高。

2. 提升檢測(cè)效率

基于數(shù)據(jù)庫技術(shù),檢測(cè)人員能夠輕松快速地獲取微生物信息,并進(jìn)行更加精準(zhǔn)的分析,從而更大程度避免可能的誤差出現(xiàn),并減少檢測(cè)過程中的人為因素,進(jìn)一步提高檢測(cè)效率。

3. 提升品質(zhì)保障水平

數(shù)據(jù)庫技術(shù)可以實(shí)時(shí)記錄和檢測(cè)數(shù)據(jù),避免了檢測(cè)歷史被篡改的問題,從而保證了數(shù)據(jù)的品質(zhì)保障和完整性,保障了檢測(cè)數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性。

四、微生物檢測(cè)的發(fā)展趨勢(shì)

1. 微生物檢測(cè)技術(shù)不斷加強(qiáng)

近年來,微生物檢測(cè)技術(shù)不斷加強(qiáng),所使用的方法越來越精細(xì),檢測(cè)效率和檢測(cè)精度也越來越高。

2. 數(shù)據(jù)庫技術(shù)快速發(fā)展

隨著數(shù)據(jù)庫技術(shù)不斷發(fā)展,數(shù)據(jù)挖掘等技術(shù)的普及和應(yīng)用,在微生物檢測(cè)領(lǐng)域的應(yīng)用將更加普遍。

3. 微生物檢測(cè)的規(guī)模將不斷擴(kuò)大

隨著人們對(duì)于健康和食品安全意識(shí)的提高,微生物檢測(cè)領(lǐng)域的檢測(cè)任務(wù)和范圍將進(jìn)一步擴(kuò)大,也將更加需要數(shù)據(jù)庫技術(shù)和數(shù)據(jù)挖掘等技術(shù)的支持。

總而言之,數(shù)據(jù)庫賦能將持續(xù)提升微生物檢測(cè)的準(zhǔn)確性和精度,從而更好地保障公眾的身體健康和食品安全,為人類社會(huì)的健康發(fā)展提供保障。

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  • biolog微生物鑒定系統(tǒng)
  • 什么是微生物鑒定

biolog微生物鑒定系統(tǒng)

這是什么問題?是否應(yīng)該完善點(diǎn)?需要原理還是參數(shù)什么的?

Biolog微生物鑒定步驟

一 檢測(cè)原理

Biolog微生物鑒定系統(tǒng)測(cè)試的是微生物在鑒定板中利用或氧化化和物的能力。測(cè)試會(huì)產(chǎn)生特征性的紫色孔模式,組成代謝指紋。所有必需的營養(yǎng)物質(zhì)和生化試劑都預(yù)先加進(jìn)96孔板中,四唑紫是一種氧化還原染料,指示碳源的利用情況。.鑒定步驟非常簡單,純化分離到的菌株經(jīng)擴(kuò)大培養(yǎng),再制成接種液加到鑒定板中。散悉在培養(yǎng)過程中,一些孔中的化學(xué)物質(zhì)能被氧化并將顯色物質(zhì)成紫色,對(duì)照孔(A-1)和陰性孔仍然為無色。鑒定板在相應(yīng)的培養(yǎng)條件下培養(yǎng)4-6小時(shí)或16-24小時(shí)即可形成代謝模式。系統(tǒng)軟件自動(dòng)和數(shù)據(jù)庫對(duì)比,如果能找到合適的匹配,就可以得出一個(gè)鑒定結(jié)果。

二 所需器材和消耗品:

?培養(yǎng)基、接種液、巰基乙酸鈉、長棉簽、接種棒、儲(chǔ)液槽、八道移液器、移液器頭、濁度儀、濁度標(biāo)準(zhǔn)品、控溫培養(yǎng)箱和相應(yīng)的鑒定板。其中接種液自行配制,接種棒、儲(chǔ)液槽可選用國產(chǎn)品牌代替。

三 鑒定步驟:

Biolog微生物鑒定樣品處理步驟

分離純化培養(yǎng)基

BUG+B

通用培養(yǎng)基加羊血

BUA+B

厭氧培養(yǎng)基加羊血

BUY

酵母培養(yǎng)基

2%ME

2%的麥芽汁提取物

革蘭氏染色和菌落菌株形態(tài)觀察

革蘭氏染色結(jié)果

革蘭氏陰性

革蘭氏陽性

厭氧菌

酵母菌

絲狀真菌

確認(rèn)實(shí)驗(yàn)

氧化酶反應(yīng)陽性

氧化酶反應(yīng)陰性、三糖鐵實(shí)驗(yàn)A/A或K/A

需在巧克力培養(yǎng)基上或需要6.5% CO2培養(yǎng)

確認(rèn)實(shí)驗(yàn)

氧化酶反應(yīng)陰性、三糖鐵實(shí)驗(yàn)K/K或K/Aw

微生物類型

GN-NENT

非腸道菌

GN-ENT

腸道菌

GN-FAS

苛生菌

GP-COCCUS-ROD桿球菌、GP-COCCUS球菌、GP-ROD桿菌

GP-ROD

(芽孢桿菌)

AN

厭氧菌

YT

酵母菌

FF

絲狀真菌

擴(kuò)大培養(yǎng)基

BUG+B

BUG+B

巧克力培養(yǎng)基

BUG+B

BUG+M+T

BUA+B

BUY

2%ME

培養(yǎng)溫度

30℃

35-37℃

35-37℃

35-37℃

30℃

35-37℃

26℃

26℃

培養(yǎng)氣體

空氣

空氣沖族乎

6.5% CO2

空氣或6.5% CO2

空氣

無氫氣的厭氧環(huán)境

空氣

空氣

接種液類型

GN/GP-IF

GN/GP-IF+T

GN/GP-IF+T

GN/GP-IF+T

GN/GP-IF

AN-IF

FF-IF

接種濁度/

濁度標(biāo)準(zhǔn)管

52%T

GN-NENT

61%T

GN-ENT

20%T

GP-COC&GP-ROD&GN-FAS

20%T

GP-COC&GP-ROD&GN-FAS

28%T

GP-ROD SB

65%T

AN

47%T

YT

75%T

FF

鑒定板類型/

每孔菌懸液的量

GN2

150μl

GN2

150μl

GN2

150μl

GP2

150μl

GP2

150μl

AN

100μl

YT

100μl

FF

100μl

培養(yǎng)時(shí)間(小時(shí))

4-6,16-24

4-6,16-24

4-6,16-24

4-6,16-24

4-6,16-24

20-24

24,48,72

24,48,72,96

之一步:

在用戶自己的培養(yǎng)基上純化菌株,如果菌株為凍干或冷凍樣品,需要傳代培養(yǎng)2-3代,讓菌株恢復(fù)活力。

對(duì)純化好的菌株做革蘭氏染色,確定菌株是革蘭氏陰性還是陽性。觀察菌落外部形態(tài)或用顯微鏡觀察菌株形態(tài),確定是酵母還是絲狀真菌,是球菌還是桿菌。

如果是革蘭氏陰性菌,還需要最終確認(rèn)是腸道菌、非腸道菌或苛生菌。方法是,氧化酶陽性或氧化酶陰性但三糖鐵實(shí)驗(yàn)為K/K或K/Aw,則該菌株為非腸道菌(GN-NENT),氧化酶陰性以及三糖鐵實(shí)驗(yàn)為A/A或K/A,則該菌株為腸穗磨道菌(GN-ENT)。如果菌株①需要在巧克力培養(yǎng)基上或需要6.5% CO2培養(yǎng),②在BUG+B培養(yǎng)基上生長非常差,形成針尖大小的菌落,那么可以認(rèn)為這些菌是苛生菌(GN-FAS)。大多數(shù)苛生菌都是從哺乳動(dòng)物的呼吸道里分離出來的,如Actinobacillus, Alysiella, Brucella, Capnocytophaga, CDC Group DF-3, CDC Group EF-4, Eikenella, Haemophilus, Kingella, Moraxella, Neisseria, Simonsiella, Suttonella,和Taylorella。

如果是革蘭氏陽性菌,用革蘭氏染色可以很容易的區(qū)分球菌和桿菌,推薦再做一個(gè)過氧化氫酶實(shí)驗(yàn),最終確定是球菌還是桿菌。通過革蘭氏染色或觀察菌落形態(tài)可以區(qū)分出芽孢桿菌。

微生物的擴(kuò)大培養(yǎng)應(yīng)該用Biolog推薦的培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件,以便使微生物達(dá)到更佳的代謝活性,進(jìn)而準(zhǔn)確的和數(shù)據(jù)庫中的代謝模式匹配。

微生物應(yīng)該是新鮮的,確保其處于指數(shù)增長期,因?yàn)橐恍┚暝谶_(dá)到穩(wěn)定期時(shí)會(huì)失去生存能力或代謝活性,推薦的培養(yǎng)周期為4-24個(gè)小時(shí)。

如果擴(kuò)大培養(yǎng)的量不足以配制相應(yīng)的濁度,可以培養(yǎng)多個(gè)平板,培養(yǎng)時(shí)間可以延長到48個(gè)小時(shí)。

第二步:

首先確定濁度儀沒開啟電源的時(shí)候,指針應(yīng)指在0%,如果沒有,用螺絲刀調(diào)整。開啟電源,取未開蓋的裝有接種液的試管,擦干凈管壁,放入濁度儀,指針應(yīng)指在100%,如果沒有,旋動(dòng)右方旋鈕?。然后用濁度標(biāo)準(zhǔn)管檢驗(yàn),讀數(shù)在±2%都是正常的。要使用哪管接種液,就用相應(yīng)的試管做100%校正,不要在濁度儀的光路中旋轉(zhuǎn)試管。

? 在鑒定革蘭氏陰性腸道菌和苛生菌的時(shí)候,在接種液里應(yīng)該加準(zhǔn)確三滴巰基乙酸鈉。巰基乙酸鈉的作用是抑制芽孢形成,并且可以部分或完全的抑制A-1或其它孔由于微生物利用自身分泌的聚多糖莢膜而出現(xiàn)的紫色。一些非腸道菌液需要添加巰基乙酸鈉。

按照下列步驟制備均勻的菌懸液:用接種液將棉簽稍微浸濕,用棉簽在菌落上面輕輕的滾動(dòng)可以將菌落取到接種液中,從而不會(huì)將培養(yǎng)基或其它營養(yǎng)物質(zhì)帶入接種液。先取單菌落,不夠再取生長緊密的菌落。在試管內(nèi)壁接種液液面的上方,旋轉(zhuǎn)擠壓棉簽可以將菌落團(tuán)分散。然后上下移動(dòng)棉簽,將分散的菌落和接種液充分混合形成均一,無菌團(tuán)的菌懸液。如果菌懸液有菌團(tuán),可以讓菌團(tuán)沉到管底。

?? 調(diào)整濁度直至達(dá)到允許的范圍,增加接種液或添加菌落可以降低或升高菌懸液的密度。

?? 將菌懸液接種到鑒定板上,不要超過20分鐘。如果長時(shí)間部接種到鑒定板上,一些菌會(huì)失去代謝活性。

第三步:

?? 將鑒定板編上相應(yīng)的號(hào)碼。把菌懸液倒入儲(chǔ)液槽,不要全部倒入,因?yàn)樵嚬艿撞靠赡苡形捶稚⒌木鷪F(tuán)。按照不同的鑒定板所需的加樣量進(jìn)行移液器的程序選擇,將移液器頭安放到移液器上,必要時(shí)可以用手加固,以免造成上方漏氣。吸取菌懸液,觀察每個(gè)移液器頭中的液面是否一致,如果不一致,放出菌懸液,加固移液器頭。加完菌懸液后,蓋上蓋子。

第四步:

培養(yǎng)環(huán)境根據(jù)所鑒定的菌株種類而定。準(zhǔn)備一個(gè)塑料容器,在底部鋪上濕紙巾,把鑒定板放在紙巾上,可以防止鑒定板外緣孔水分的蒸發(fā)。對(duì)于革蘭氏陰性陽性菌,鑒定板培養(yǎng)4-6個(gè)小時(shí)可以進(jìn)行一次讀數(shù),過夜培養(yǎng)(16-24個(gè)小時(shí))可再進(jìn)行一次讀數(shù)。厭氧菌在培養(yǎng)20-24個(gè)小時(shí)后進(jìn)行一次讀數(shù)即可。酵母和絲狀真菌所需培養(yǎng)時(shí)間稍長,一般間隔24個(gè)小時(shí)讀一次數(shù)。

第五步:

開啟讀數(shù)儀和電腦,打開Biolog軟件,并對(duì)讀數(shù)儀進(jìn)行初始化,設(shè)置好各項(xiàng)參數(shù)(培養(yǎng)時(shí)間、菌株名稱、菌株編號(hào)、菌株類型),用紙巾擦干凈培養(yǎng)好的鑒定板底部,放入讀數(shù)儀,A-1孔位于左上方。即可點(diǎn)擊“Read This”進(jìn)行讀數(shù)。鑒定結(jié)果自動(dòng)顯示在屏幕下方,將所得數(shù)據(jù)進(jìn)行保存即可。

biolog是根據(jù)微生物利用碳源的情況鑒定微生物多樣性的實(shí)驗(yàn)方法

什么是微生物鑒定

自動(dòng)微生物鑒定系統(tǒng)是傳統(tǒng)的微生物鑒定主要參考《伯杰式細(xì)菌鑒定手冊(cè)》和《真菌鑒定手冊(cè)》,鑒定過程繁瑣,耗時(shí)長,容易出錯(cuò),對(duì)經(jīng)驗(yàn)要求非常高。

商品化的自動(dòng)微生物系統(tǒng)有效地解決了這個(gè)問題,目前自動(dòng)微生物鑒定系統(tǒng)從原理上包括以下幾種:

1)基于表型的鑒定方法:辯槐如美國Biolog公司臘轎的Microstation和Omnilog自動(dòng)微生物鑒定系統(tǒng),基于95種碳源或化學(xué)敏感物質(zhì)的利用為原理,可鑒定細(xì)菌、酵母和霉菌超過2650種;另外還有基于脂肪酸鑒定的方法,采用氣相色譜分析微生物細(xì)胞壁的脂肪酸構(gòu)成;在臨床領(lǐng)域,梅里埃、BD、熱電和西門子都有相應(yīng)的自動(dòng)微生物鑒定系統(tǒng),其數(shù)據(jù)庫主要以鑒定致病菌為主,通常是種數(shù)據(jù)庫,可做藥敏測(cè)試;

2)基于基因型的鑒定方法:如基因測(cè)序法及基因條帶圖譜法,以Life和杜邦為輪灶肆典型代表。

3)基于蛋白的鑒定方法:以布魯克和梅里埃為代表,基于蛋白質(zhì)飛行質(zhì)譜平臺(tái),分析不同高度保守的微生物核糖體蛋白電解離后的電子飛行時(shí)間進(jìn)行鑒定。

三類方法各有優(yōu)缺點(diǎn),理論上不沖突,應(yīng)該互為補(bǔ)充,應(yīng)根據(jù)需要進(jìn)行選擇。

在同一載玻片上兩端,進(jìn)行:已知菌金胡稿輪黃色葡萄球菌和需要鑒敬物定的未知桿菌,進(jìn)行革蘭氏染色。

在另一載玻片上兩端,進(jìn)行:已知菌大腸桿菌和需要鑒定的未知褲信桿菌,進(jìn)行革蘭氏染色。

進(jìn)行對(duì)比??葱枰b定的桿菌和哪種已知菌革蘭氏染色結(jié)果相同,即可!

微生物檢測(cè)中的數(shù)據(jù)庫的介紹就聊到這里吧,感謝你花時(shí)間閱讀本站內(nèi)容,更多關(guān)于微生物檢測(cè)中的數(shù)據(jù)庫,微生物檢測(cè):數(shù)據(jù)庫賦能讓分析更精準(zhǔn),biolog微生物鑒定系統(tǒng),什么是微生物鑒定的信息別忘了在本站進(jìn)行查找喔。

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